大规模免疫分析有助于深入了解流感病毒的进化

一项新的研究表明，抗体免疫的人与人之间的差异在决定流感病毒株在人群中占主导地位方面发挥着关键作用。 这项工作今天作为经审查的预印本发表在 eLife 上，它使用基于高通量测序的测定来量化儿童和成人针对流行的 H3N2 流感病毒株的抗体免疫力。编辑们将其描述为一项重要的研究，它增进了我们对人群水平免疫的理解，并表示证据的强度令人信服。这项工作将引起免疫学家、病毒学家、疫苗开发人员和从事传染病数学模型研究的研究人员的兴趣。 流感病毒会积累突变，帮助它们逃避先前感染或接种疫苗后免疫系统产生的抗体。这个过程意味着人们一生中可能会多次再次感染流感，疫苗必须定期更新才能保持有效性。人类对流感的免疫反应是由多种因素决定的，包括个人以前遇到过的病毒株。 “一群人的感染和疫苗接种史的差异意味着人群对特定流感变种的免疫力存在很大差异，”共同主要作者 Caroline Kikawa 说道，她是美国西雅图华盛顿大学基因组科学系以及美国西雅图 Fred Hutch 癌症中心基础科学和计算生物学项目部的医学博士/博士生。 “了解人群中抗体的多样性如何影响新流感病毒株的进化成功仍然具有挑战性，部分原因是量化抗体水平的传统方法太慢，并且一次只能评估少量样本。” Kikawa 与 Fred Hutch 癌症中心基础科学和计算生物学项目部资深作者 Jesse Bloom 实验室的研究员兼实验室经理 Andrea Loes 一起担任该研究的主要作者。 为了应对这一挑战，Kikawa、Loes 及其同事开发了一种高通量中和测定法来测量单个血清样本的效果——血液中含有抗体的成分——可以阻止一组不同流感病毒的感染。高通量是指检测同时处理大量数据的能力。 该团队从 2023 年流行的流感病毒和最近的疫苗株中产生了表达 78 种不同血凝素 (HA) 蛋白的病毒，并为每一种病毒都贴上了独特的基因“条形码”标签。 HA蛋白是抗体识别的病毒的一部分，可以快速变化以逃避免疫反应。研究小组将这些病毒与血清混合，并使用一种称为 Illumina 测序的技术来量化每种病毒的中和程度。