Le profilage immunitaire à grande échelle donne un aperçu de l’évolution du virus de la grippe

Une nouvelle étude a montré que la variation de l’immunité des anticorps d’une personne à l’autre joue un rôle clé dans la détermination des souches de grippe (grippe) dominantes dans une population. Le travail, publié aujourd'hui sous forme de préimpression révisée dans eLife, utilise un test basé sur le séquençage à haut débit pour quantifier l'immunité des anticorps contre les souches de grippe H3N2 en circulation chez les enfants et les adultes. Les éditeurs décrivent cela comme une étude importante qui fait progresser notre compréhension de l’immunité au niveau de la population et affirment que la solidité des preuves est convaincante. Ces travaux intéresseront les immunologistes, les virologues, les développeurs de vaccins et les chercheurs travaillant sur la modélisation mathématique des maladies infectieuses. Les virus de la grippe accumulent des mutations qui les aident à échapper aux anticorps générés par le système immunitaire après des infections ou des vaccinations antérieures. Ce processus signifie que les gens peuvent être réinfectés par la grippe plusieurs fois au cours de leur vie, et les vaccins doivent être régulièrement mis à jour pour rester efficaces. La réponse immunitaire humaine à la grippe est façonnée par divers facteurs, notamment les souches qu’un individu a déjà rencontrées. "Les différences dans les antécédents d'infection et de vaccination au sein d'un groupe de personnes signifient que l'immunité de la population contre une variante spécifique de la grippe est très variée", a-t-il déclaré. » déclare Caroline Kikawa, co-auteure principale, étudiante en médecine/doctorat au Département des sciences du génome, Université de Washington, Seattle, États-Unis, et à la Division des sciences fondamentales et du programme de biologie computationnelle, Fred Hutch Cancer Center, Seattle, États-Unis. "Comprendre comment cette variété d'anticorps au sein d'une population affecte le succès évolutif des nouvelles souches de grippe reste un défi, en partie parce que les méthodes conventionnelles permettant de quantifier les niveaux d'anticorps sont trop lentes et ne peuvent évaluer qu'une poignée d'échantillons à la fois." Kikawa a été l'auteur principal de l'étude aux côtés d'Andrea Loes, scientifique et responsable de laboratoire du laboratoire de l'auteur principal Jesse Bloom, Division des sciences fondamentales et programme de biologie computationnelle, Fred Hutch Cancer Center. Pour relever ce défi, Kikawa, Loes et leurs collègues ont développé un test de neutralisation à haut débit pour mesurer l'efficacité des échantillons de sérum individuels - et ainsi de suite. le composant du sang qui contient des anticorps - peut bloquer l’infection par un panel de différents virus de la grippe. Le haut débit fait référence à la capacité du test à traiter simultanément de grandes quantités de données. L'équipe a produit des virus exprimant 78 protéines d'hémagglutinine (HA) distinctes provenant de virus de la grippe circulant en 2023 et de souches vaccinales récentes, et a étiqueté chacun d'entre eux avec un « code-barres » génétique unique. Les protéines HA font partie du virus reconnu par les anticorps et peuvent rapidement changer pour échapper à la réponse immunitaire. L’équipe a mélangé ces virus avec des sérums et a utilisé une technique appelée séquençage Illumina pour quantifier dans quelle mesure chaque virus était neutralisé.